วัดคลองท่อม เป็นวัดราษฎร์ ตั้งอยู่หมู่ที่ ๒ ตำบลคลองท่อมใต้ อำเภอคลองท่อม จังหวัดกระบี่ ได้รับพระราชทานวิสุงคามสีมา เมื่อวันที่ ๑๐ เดือนกรกฎาคม พ.ศ.๒๕๐๔  มีเนื้อที่ประมาณ ๒๗ ไร่ ๓ งาน ๖๗ ตารางวา และมีที่ธรณีสงฆ์อีก ๑ แปลง เนื้อที่ ๕๔ ไร่ ๒ งาน ๑๓ ตารางวา 

     สภาพพื้นที่ตั้งวัดนั้นเดิมเป็นที่ราบลุ่มและมีน้ำขัง  จึงมีการถมดินให้สูงขึ้น  สภาพแวดล้อมของวัดนั้น เป็นทุ่งนา ป่าเบญจพรรณ และลำคลองในปัจจุบันถึงแม้ว่าวัดคลองท่อมจะตั้งอยู่ใจกลางอำเภอคลองท่อม  แต่ก็ยังคงมีความร่มรื่น  สงบเงียบ  และมีแนวป่าไม้ เบญจพรรณนานาชนิดอยู่ทั่วบริเวณ

       เมื่อ พุทธศักราช ๒๔๕๑ พ่อท่านจันทร์ ร่วมกับข้าราชการ พ่อค้าและประชาชน ในการริเริ่มสร้างที่พำนักสงฆ์ขึ้น  เพื่อให้พระภิกษุสามเณรได้พักแรม เมื่อมีพระภิกษุเข้าไปอยู่ประจำ พ่อค้าประชาชนจึงได้ร่วมกันสร้างศาลาการเปรียญ  (โรงธรรม) และกุฏิเพิ่มขึ้นแล้วเรียกขานที่พำนักสงฆ์คลองท่อมว่า “วัดคลองท่อม” เรื่อยมา

        พุทธศักราช ๒๔๙๘ ตรงกับเดือน ๗ พระสวาส กนฺตสํวโร ได้มาพำนักอยู่วัดคลองท่อม มีพระภิกษุ ๑ รูป  มีศาลาการเปรียญเก่า (โรงธรรมโบราณ) และมีกุฏิ ๑ หลัง ได้แสดงพระธรรมเทศนา อบรมสั่งสอนประชาชนจนมีจิตศรัทธาเลื่อมใสในพระพุทธศาสนาและได้เข้ามาขอบรรพชาอุปสมบทเป็นพระภิกษุ พรรษาแรกมีพระภิกษุจำนวน ๒๔ รูป  เมื่อมีพระภิกษุมากจึงชักชวนข้าราชการ พ่อค้า ประชาชนร่วมกันสร้างเสนาสนะสงฆ์ และร่วมกันบูรณปฏิสังขรณ์ศาลาการเปรียญใหม่เพื่อให้พระภิกษุสามารถบำเพ็ญกิจวัตรและอยู่จำพรรษาในครั้งนั้น

       พุทธศักราช ๒๔๙๙ ได้ทำการขุดบ่อน้ำ เพื่อใช้ในกิจการพระภิกษุสงฆ์ (ปัจจุบันเลิกใช้แล้ว)  และก่อสร้างเสนาสนะสงฆ์ เพื่อให้พระภิกษุจำพรรษาได้ ก่อสร้างโรงครัวขึ้น และดำเนินการก่อสร้างเป็นลำดับมาจนถึงปัจจุบัน

        ปัจจุบันวัดคลองท่อมได้มีการพัฒนาอย่างต่อเนื่อง ทั้งการสร้างเสนาสนะสงฆ์ การพัฒนาภูมิทัศน์ให้ดูสวยงาม การบูรณปฏิสังขรณ์ฌาปนสถานให้ทันสมัยขึ้น เป็นต้น และจากการที่วัดคลองท่อมนั้นเป็นที่ตั้งของพิพิธภัณฑ์วัดคลองท่อม (พิพิธภัณฑสถานพระครูอาทรสังวรกิจ) วัดคลองท่อมจึงเป็นที่รู้จักแพร่หลายมากขึ้นทั้งในและนอกประเทศ โดยในแต่ละวันนั้นมีนักท่องเที่ยวทั้งชาวไทยและชาวต่างชาติ เข้าเยี่ยมชมพิพิธภัณฑ์ทุกวันมิได้ขาด อีกทั้งยังเป็นแหล่งความรู้ด้านโบราณคดีและประวัติศาสตร์ท้องถิ่นจึงมีนักเรียนนักศึกษาจากสถานศึกษาต่าง ๆ ทั่วประเทศ  ได้มาทัศนะศึกษา ณ พิพิธภัณฑสถานแห่งนี้เป็นประจำตลอดทั้งปี